บทนำ ประวัติเบื้องต้น และความสำคัญของจุลินทรีย์ในน้ำ มลพิษทางน้ำ แหล่งของมลพิษ สารพิษในน้ำ ยูโทรฟิเคชันสิ่งแวดล้อมทางน้ำต่างๆในฐานะที่เป็นถิ่นที่อยู่ของจุลินทรีย์ จุลินทรีย์ที่อาศัยอยู่ในแหล่งน้ำ เช่น แบคทีเรีย ฟังไจ ไซยา-โนแบคทีเรีย สาหร่าย ไวรัส และโปรโตซัว ผลของสิ่งแวดล้อมทางน้ำที่มีผลการจุลินทรีย์ที่อาศัยในแหล่งน้ำ จุลินทรีย์ในแหล่งน้ำใต้ดิน จุลินทรีย์ในแหล่งน้ำจืด จุลินทรีย์ในพื้นที่ชุ่มน้ำและหนองบึง (ที่ลุ่ม ตม เขตน้ำกร่อย บึง ปลักตมและบึงปลัก จุลินทรีย์ในสิ่งแวดล้อมที่เครียด จุลินทรีย์และน้ำเสีย บทบาทของจุลินทรีย์ในการบำบัดน้ำเสีย จุลินทรีย์ที่เกี่ยวข้องกับน้ำดื่ม คุณภาพน้ำ และจุลินทรีย์ที่ก่อให้เกิดโรคที่เกี่ยวข้องกับน้ำ จุลินทรีย์ในการบำบัดน้ำเสีย จุลินทรีย์กับปลาและสิ่งมีชีวิตในน้ำชนิดอื่น                       

Introduction, historical background & importance of microorganisms in water, water as biotopes for microorganism, the microorganisms of water . The influence of environmental factors on the development of microorganisms and water  sampling method, groundwater microbiology,  and freshwater microbiology, Wetland and swamp microbiology, Microbial life in extreme environment, extreme environments, cold and freezing environments, microbiology of high temperature  environments (hot springs, hydrothermal vents), microorganisms and water pollution, the role of microorganisms in the purification of waters, microorganisms from the fish and other aquatic animal.